超级计算机

地大物博，通常被用于形容我们的祖国，特别是针对能源行业。事实证明，中国的能源蕴藏量位居世界前列，但是同时也是世界第二大能源生产国与消费国。而在寻找与勘探这些能源的过程中，为了确保数据的正确和提高效率，高性能计算机的应用则显得必不可少。

在往期的几篇IT号外文章中，我们分别就目前HPC产业的整体发展(HPC走下“神坛”)，HPC面临的主要问题(计算“超人”也有烦心事)以及这些问题背后所透露的原因症结做了反思和梳理(HPC深度分析：火热中的反思)。通过这些分析我们发现IT巨头英特尔在推动高性能计算上有着值得称道的表现(英特尔带来全方位助力)，不论是其SSG部门为用户排忧解难还是最新的至强5500处理器给HPC带来优异的计算性能都证实着TOP 500排名所言不虚——500台超级计算机中有402台采用的是英特尔至强系列处理器

本篇案例则要与大家分享作为教育机构、国内知名高校的南京大学构建HPC系统前前后后的故事，以及它选用英特尔至强5500的原因。

院方也曾经采用过SMP超级计算方案，但是随着时间的推移和研究人员人数的激增，原有的超级计算机无论在性能上，还是在功能上都已经无法满足未来应用的需要。

12月3日，中科院北京基因组研究所和浪潮集团在京达成战略合作，计划在3年内推出达到国际领先水平的第三代基因测序仪。届时，个体化基因组测序成本有望降低到只有几千元，仅是目前测序成本的1%。

国内HPC产业的参与厂商不仅要为用户提供创新的、实打实的技术解决方案，还应该积极参与到推动HPC商业化、HPC产品化、用户和人才培育的事业中来

通过上述分析，相信大家已对横亘在中国HPC产业和应用发展道路上那几件烦心事的起因和应对策略有了初步了解。

美国国防部的一份招标文件近日泄漏于网上，而采购对象竟然是多达2200台索尼PS3游戏机。按照文件描述，它们将被用来组建一套高性能计算集群。

本次大会上，来自中科院软件所的杨超助理研究员就地球物理计算的两个典型问题的算法优化在三台超级计算机上跑了有关测试——分别是IBM的“蓝色基因”（BlueGene/L），曙光的“魔方”（曙光5000A），以及联想的深腾7000。

来自国防科技大学计算机学院的张卫民主任简单介绍了组成“天河一号”的几大系统，并就其技术细节回答了现场提问。他表示，“天河一号”由硬件系统、软件系统构成。其中硬件系统由计算和加速阵列、服务阵列、互联通信子系统、I/O存储子系统以及监控诊断子系统组成。整个“天河一号”采用了多阵列可配置异构协同并行计算体系结构(MCCP)。

在Nvidia有关GPU并行计算和生态环境为主题的报告中，来自Nvidia公司的中国PSG销售经理谢强先生表示，Nvidia公司是最早将GPU推向通用计算领域的公司之一，而且最先推出了CUDA架构，其1.0版本就已经支持经典的C语言编程环境——这对并行计算编程难的问题来说无疑是一个重要里程碑。据了解，Nvidia公司将于今年末，明年初的时候(笔者认为极有可能是明年初，与“Fermi”一同)发布CUDA 3.0，届时将全面支持包括C语言，Fortran语言，OpenCL语言和面向对象的C++语言编程环境。

11月26日，2009年全国高性能算法软件研究开发研讨会，暨中国软件行业协会数学软件分会理事会年会在京召开。大会计划为期两天，主要就中国高性能计算Top 100排行榜作出相关报告并予以颁奖。会议期间，还将有包括Dell，Nvidia，惠普，IBM，浪潮，中科软等企业就最新的技术和产品应用作有关演讲——请关注IT168的后续报道。

通过我们11月24日发布的上一篇IT号外文章——“HPC走下‘神坛’”，相信大家已充分认识到了HPC技术的实用价值。

以往提起高性能计算(HPC)或超级计算机(Supercomputer)，国人总有一种“高处不胜寒”的感觉，总觉得它离我们这些普通大众的生活很远，或认为只有发达国家才玩得起这种顶尖技术。

一年一度的全国高性能计算(HPC)学术年会在长沙成功举办。此次会议吸引了全国各地300多位高性能计算从业人员的参与。此次会议的两件大事引起了各界的广泛关注：国防科技大学成功研制国内首台千万亿次计算机“天河一号”;本年度的国内TOP100高性能计算机排名正式公布，曙光取代惠普连续七届榜首的神话，曙光首度以27套高性能计算机入榜TOP100，成为入选套数最多的厂商，并有2套高性能计算机入围前十名，分别是峰值运算速度233万亿次部署在上海超算中心的曙光5000A和峰值40万亿次部署在计算物理国家级重点实验室的曙光5000系统。

IBM公司深度计算业务副总裁David Turek近日在SC09高性能计算会议上向媒体确认，IBM已经终止了开发下一代Cell架构处理器的计划。不过他还表示，Cell架构的设计理念并不会被放弃，而是会在未来以另外一种方式保留下来。

今天我们非常荣幸邀请到了在这个领域里面有着21年从业经验的专家——微软中国研发集团高性能计算首席架构师徐明强博士。

11月17日， Sun Microsystems公司(NASDAQ: JAVA)宣布推出一系列新产品和新技术，扩大了Sun的高性能计算领先优势，最大限度地提高了应用性能和吞吐量

千万亿次高性能计算机代表一个国家计算技术的尖端科研能力。继“天河一号”的诞生后，高性能计算机再一次成为关注的焦点。尤其是备受关注的完全自主知识产权的曙光6000成为业界谈论的主要话题。曙光6000何时发布?和采用GPU加速的天河一号有何不同?采用自主创新科技研发的国产千万亿计算机能否超越天河一号?这些疑问顿时成为用户和网民们关注的焦点。

我国首个千万亿次级超级计算中心建设昨在深圳启动，预计于明年11月高交会期间投入运行。